Le Centre de Traitement des Données (CTD) est une plateforme du Centre François Baclesse, soutenue par le Cancéropôle Nord-Ouest, labellisée par l’INCa en 2007 et par la Ligue Nationale contre le Cancer depuis 2006.
Contacts
L’équipe
- Directeur : Brice DUBOIS
L’équipe du CTD-CNO se compose de 7 personnels permanents, biostatisticiens et data managers tous affiliés au Centre François Baclesse. Elle accueille régulièrement de 1 à 3 stagiaires universitaires.
Activités
Les missions du CTD-CNO sont d’apporter :
- une expertise méthodologique pour la conception des protocoles et des cahiers d’observation ;
- une aide logistique informatique permettant de garantir la qualité des données recueillies ;
- une expertise statistique pour l’analyse des résultats et une collaboration à la valorisation des résultats.
Le CTD est certifié ISO 9001 : 2015 pour ses activités de data management depuis novembre 2017.
Moyens techniques
Les data managers du Centre de Traitement des Données du Cancéropôle Nord-Ouest sont experts dans la gestion des données de recherches biomédicales et peuvent justifier de plusieurs années de pratique au développement de CRF (Case Report Form ou cahier d’observation) électroniques, à la fois dans le design et la conception sur différents logiciels métiers, actuellement Ennov ClinicalTM (conforme aux attentes de la FDA et de l’EMA).
Le CTD-CNO met à la disposition des utilisateurs un accès réseau ultra-sécurisé au logiciel de gestion (identifiants et mots de passe personnels) et garantit la pérennité des données (sauvegardes journalières, stockage sur deux serveurs dans des lieux différents, transmission cryptée des données).
Pour l’analyse statistique, les logiciels SASTM, R et StataTM sont largement utilisés au CTD-CNO à la fois pour leurs puissances de calcul, pour l’exhaustivité de leurs procédures et pour leurs possibilités de développement. Pour les analyses sur petits échantillons sur lesquelles les méthodes asymptotiques sont limitées, les logiciels StatXactTM et LogXactTM peuvent également être utilisés.
Pour la méthodologie statistique, différents outils de calcul du nombre de sujets nécessaire sont disponibles : nQueryAdvisorTM, nTerimTM et nPIITM. Pour les recherches biomédicales conçues sur un design statistique original, différentes méthodes de calcul de nombre de sujets par méthodes de Monte-Carlo sont également développées sous R.
Pour les analyses de données de génomiques, les suites logicielles PLINK, SamTools et R-bioconductor sont utilisées pour permettre de coupler des traitements bioinformatiques des données avec les analyses statistiques.
Partenariats
- Direction de la Recherche Clinique et de l’Innovation du CLCC de Caen, Centre François Baclesse
- Direction de la Recherche Clinique et de l’Innovation du CLCC de Rouen, Centre Henri Becquerel
- Direction de la Recherche Clinique et de l’Innovation du CHU de CAEN
- Direction de la Recherche Clinique et de l’Innovation du CHU de ROUEN
- Unité Inserm U1086 ANTICIPE
- Unité Inserm U1237, Physiopathologie et imagerie des troubles neurologiques PhIND, Centre Cycéron
- Unité Inserm U1245, Genomic and Personalized Medicine in Cancer and Neurological disorders
- Réseau OncoNormandie
- Cancéropôle Nord-Ouest
- Université de Lille, UMR 9193 SCALab- Sciences Cognitives et Affectives
- Direction de la Recherche Clinique et de l’Innovation du CHU d’AMIENS
- Direction de la Recherche Clinique et de l’Innovation du CHU de LILLE
- Direction de la Recherche Clinique et de l’Innovation du CHU de NICE
- Direction de la Recherche Clinique et de l’Innovation du CLCC de Lille, Centre Oscar Lambret
- Direction de la Recherche Clinique et de l’Innovation du CLCC de Nancy, Institut de Cancérologie de Lorraine
- Direction de la Recherche Clinique et de l’Innovation des CLCC d’Angers et Nantes, Institut de Cancérologie de l’Ouest
- Le Groupe Oncologie-hématologie Adolescents et Jeunes Adultes AJA (Go-AJA)
- Le Groupe Coopérateur en Oncologie ARCAGY-GINECO
- Le Groupe coopérateur francophone « Lymphoma Study Association » (LYSA)
- Le Groupe coopérateur Lymphomes de l’Organisation Européenne de Recherche et de Traitement des Cancers (OERTC)